Santa Catarina Mita: Historia
Se cree que los primeros habitantes del área que ocupa el municipio fueron pocomames, toltecas y pipiles procedentes de México. Los primeros habitantes fundaron a todo el terreno que comprende a los modernos municipios de Santa Catarina, Asunción Mita, Agua Blanca y Atescatempa con el nombre de Mictlán; los principales pueblos de Mictlán eran la Asunción y Santa Catarina y por problemas políticos, religiosos y administrativos decidieron dividir estos dos pueblos bautizándolos con sus actuales nombres conservando el nombre de "Mita". En los primeros tiempos de Santa Catarina, se registró una cantidad total de 1,150 habitantes en el municipio y todos los habitantes hablaban el idioma pocomam.
Tras la Independencia de Centroamérica en 1821, la constitución del Estado de Guatemala promulgada el 11 de octubre de 1825 estableció los circuitos para la administración de justicia en el territorio del Estado y menciona que Santa Catarina Mita —llamada entonces simplemente «Santa Catarina»— era parte del Circuito de Mita en el Distrito N.º 3 del mismo nombre en el departamento de Chiquimula, junto con Asunción, Achuapa, Agua Blanca, Quequesque, San Antonio, Anguiatú, Las Cañas, Limones, Mongoy, Espinal, Hermita, Jutiapa, Chingo, Atescatempa, Yupiltepeque, Zapotitlán, Papaturro y San Diego.
La República de Guatemala fue fundada por el gobierno del presidente capitán general Rafael Carrera el 21 de marzo de 1847 para que el hasta entonces Estado de Guatemala pudiera realizar intercambios comerciales libremente con naciones extranjeras. El 25 de febrero de 1848 la región de Mita fue segregada de Chiquimula, convertida en departamento y dividida en tres distritos: Jutiapa, Santa Rosa y Jalapa. Específicamente, el distrito de Jutiapa incluyó a Jutiapa como cabecera, Yupiltepeque, Asunción y Santa Catarina Mita y los valles aledaños que eran Suchitán, San Antonio, Achuapa, Atescatempa, Zapotitlán, Contepeque, Chingo, Quequesque, Limones y Tempisque; además, incluía a Comapa, Jalpatagua, Asulco, Conguaco y Moyuta.
El 9 de noviembre de 1853 Santa Catarina se fundó como municipio oficial del departamento de Jutiapa.