Municipio de Empalme: Historia como municipio
En el territorio que ocupa el municipio habitaban los nativos de las etnias guaima y yaqui en la época precolombina en la ranchería de Cochórit. Durante la conquista de México y que transcurría la evangelización de la nativos del noroeste del país, esta zona de la costa se usó como arribo de algunas familias y exploradores provenientes de Europa, sobre todo en el puerto de Guaymas. Cerca de 1780, se tenían datos de un asentamiento al sur del territorio llamado La Ladrillera. En 1825 se mencionaba a Cochórit como una de las principales poblaciones de la parroquia de la misión de Guaymas. En 1904 se comenzó con la construcción del una línea de ferrocarril que conectaba inicialmente a Guaymas con Guadalajara, después en 1905 se planificó conectarlo con el ferrocarril de Sonora, en ese lugar del entronque de ambas vías se fundó un asentamiento conociéndose ahí como "Junction" palabra en inglés que significa "unión", que después sería nombrado Empalme, la localidad se formó como una comisaría del municipio de Guaymas. El 8 de mayo de 1937, se creó por primera vez el Municipio de Empalme, gracias a la Ley n.º 29, conservando ese título hasta el 31 de enero de 1940, cuando se suprimió y su territorio volvió a la jurisdicción del de Guaymas, lo anterior se decretó en la Ley n.º 120. Después, el 19 de agosto de 1953 según la Ley n.º 38 se erigió de manera definitiva la municipalidad del Empalme, manteniéndose así hasta la actualidad.