Municipio de San Pedro Amuzgos: Historia
Los amuzgos vivieron libres hasta el siglo XI. A partir del año 1,100 el ejército mixteco sometió a los amuzgos a la dinastía mixteca.
Posteriormente, los amuzgos fueron dominados por los aztecas, a quienes pasaron a pagar tributo. Desde el año de 1350 en que ocurrió la dominación del imperio azteca, la población lleva el nombre de amuzgos ("entre cerros" en náhuatl), de este nombre generalizado resultó el nombre del grupo etnológico de "los amuzgos".
Posteriormente durante la colonia española, se agregó "San Pedro", que es el santo patrono de la población, el cual celebran cada año.
En 1969-1970 se dio la lucha por las tierras; la historia de la comunidad de Amuzgos no es ajena a la historia de los campesinos de Oaxaca ni a la del país en su conjunto, el elemento común es la lucha de los campesinos indígenas frente al despojo de sus tierras, originalmente de su cultura y oponiéndose a la represión, así como en contra de los planes de desarrollo o modernización.